MODYLAS、AMBER、CHARMMなどの既存の分子動力学シミュレーションソフトにレプリカ交換法の機能を付加するアプリケーション。オリジナルの分子動力学プログラムを変更 ...

生体分子シミュレーションを行うオープンソースの分子動力学アプリケーション。京コンピュータを始めとした超高並列環境に対応しており、タンパク質や生体分子の分子 ...

2022/02/06 · OpenMMは、分子動力学シミュレーションのためのオープンソースのライブラリであり、パンデ研究室によって管理されている。Python、C++、Fortranなどの ...

本項では主に分子力学法または分子動力学法の計算に用いられるプログラムの一覧を示す。 GPU – GPUが利用可能; I – インターフェースのみ; Imp – 水の陰溶媒 ...

フリーな分子動力学計算プログラムの一つである GROMACS と連携ソフトウエアを用いて、一般分子（非生体高分子）の1分子モデリングから分子集合体の計算を WindowsPC ...

分子動力学ソフトウェアで有名なGROMACS に誰もが簡単に使えるよう機能をプラス！ シミュレーションが手軽にできるようになります。... LAMMPS.

フリーな分子動力学計算プログラムの一つである LAMMPS と連携ソフトウエアを用いて、無機・金属材料の分子動力学計算を WindowsPC を用いて行う方法を説明する。

エネルギー計算/構造最適化/動力学シミュレーションが可能な最新の古典力学計算ツール。 単純な分子から二次元表面、結晶など三次元周期性構造に至るまで、広い適用性を ...

原子レベルの分子モデルを用いた分子動力学法による超並列計算を行い、各種構造生物学実験と連携しつつ、溶液中や生体膜中のタンパク質の挙動をシミュレーションします。