2015/07/21 · GGGenomeは塩基配列を高速に検索することができるツールです。代表的なモデル生物のゲノムまたは転写産物のデータベースを対象に検索できます。

重み行列に独自の閾値を用いた転写因子結合部位(TATA box, GC box, CCAAT box, 転写開始部位(TSS)を含む）検索のためのソフトウェア。アルゴリズムは、転写因子結合部位の ...

2017/11/28 · JASPARは、ノルウェーやデンマークを中心とした研究グループが開発・運用している転写因子の結合予測配列に関するオープンアクセスデータベースです。

転写因子結合サイト検索ツール。 種類：DNA配列解析; UI: ブラウザ. TOUCAN2. シスエレメント抽出ツール。

2023/12/22 · 転写因子(TF)は遺伝子の発現調節に大きな役割を果たしている。各遺伝子の制御領域に結合するTFを発見することは、長年の研究の焦点であった。

期間: 3:58
投稿: 2015/07/22

2020/12/17 · FIMO を使って特定の転写因子結合モチーフを探そう！！ ... FIMO は探したいモチーフの情報と DNA 配列を入力するとモチーフをスキャンしてくれるソフトです.

期間: 5:40
投稿: 2017/11/28

しばらくフォローしてなかったけど、JASPARが良くなっている。JASPAR CORE databaseとしてVertebrata, Nematoda, Insecta, Plantae, Fungiと生物グループごとにセットが ...

SITE：転写因子結合部位の塩基配列と位置、その部位に結合する転写因子名などの情報。 FACTOR：DNAに結合する蛋白質についての転写因子名、アミノ酸配列、構造機能的特徴。