2017/11/28 · JASPARを使って転写因子を検索し、結合予測配列を調べる. JASPARは、ノルウェーやデンマークを中心とした研究グループが開発・運用している転写因子の結合 ...
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2010/12/20 · Sequence inputs include low-coverage genome sequence data and ENCODE data. となっていて、保存されたモチーフについて、TRANSFACやJASPAR, ORegAnno ...
関連する質問
転写因子とは何か？
遺伝子の発現や転写の促進・抑制にかかわるタンパク質を？
プロモーターは転写開始にどのように関わっていますか？
転写因子が結合するDNA上の配列を何と呼ぶか？
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JASPAR. からダウンロードしたシスエレメント配列データは，. 124 種の転写因子それぞれに対して結合配列パター. ンが FASTA 形式でまとめられていた．取得したシ. ス ...
2023/04/01 · 転写因子データは、「DBTBS」や「JASPAR」を使用。 TFSEARCH (Transcriptional Factor Search), 転写因子が結合するDNA塩基配列の部位を検索できる。
2022/11/07 · JASPARで検索することで転写因子の候補遺伝子が抽出されますが、 多くのものがでてきます。 そこからの解釈が難しく、既知のものしか検索されないです ...
転写因子は特定のゲノム配列に結合することで，遺伝子の転写制御をすること ... JASPAR に登録されている PFM を PPM に変. 換し，各塩基の出現確率を利用して新た ...
しばらくフォローしてなかったけど、JASPARが良くなっている。JASPAR CORE databaseとしてVertebrata, Nematoda, Insecta, Plantae, Fungiと生物グループごとにセットが ...
文献「JASPAR 真核生物転写因子結合特性へのアクセスが開放されたデータベース」の詳細情報です。J-GLOBAL 科学技術総合リンクセンターは、国立研究開発法人科学技術 ...
転写制御解析に有用な生配列データの利用（SRA，ENA，DRA） 2．転写因子結合・ヒス. トン修飾サイトの探索（hmChIP） 3．既知転写因子結合配列の探索（TRANSFAC,. JASPAR） 4．